Proses pengundian di Nyon, Swiss, Jumat (26/2/2016), dipandu oleh Ketua Kompetisi Klub UEFA, Michael Heselschwerdt. Heselschwerdt ditemani oleh mantan striker timnas Swiss yang menjadi duta final Liga Europa 2015/2016, Alexander Frei.
Hasil undian menunjukkan bahwa Liverpool harus berduel dengan Manchester United di babak 16 besar. Pertemuan ini menjanjikan dua laga sengit meningat status mereka sebagai dua klub tersukses di Inggris.
Liverpool vs Manchester United bukan satu-satunya duel menarik di babak ini. Pertemuan Borrusia Dortmund dan Tottenham Hotspur juga layak untuk dinantikan.
Leg pertama babak 16 besar akan dilangsungkan pada 10 Maret mendatang, sementara leg kedua akan digelar pada 17 Maret.
Hasil undian babak 16 besar Liga Europa: (tim yang disebut lebih dulu menjadi tuan rumah di leg pertama)
FC Shaktar Donetsk vs Anderlecht
Basel vs Sevilla
Villareal vs Bayer Leverkusen
Athletic Bilbao vs Valencia
Liverpool vs Manchester United
Sparta Praha vs Lazio
Borussia Dortmund vs Tottenham Hotspur
Fenerbahce vs Braga